El parentesco de los animales, es decir su paternidad, filiación etc. puede determinarse mediante los análisis de las diferencias en marcadores genéticos tipo 'microsatélites de DNA'. Para ello es necesario determinar el número y tipo de marcadores microsatélite utilizados y amplificar estos marcadores por PCR. Teniendo en cuenta que cada individuo tiene un número de repeticiones determinado de cada microsatélite, si conocemos el perfil de microsatélites de uno o ambos progenitores podremos determinar la paternidad.
La trazabilidad reproductiva y alimentaria también es fundamental para la identificación del origen del animal, para asegurar la genealogía de los animales en programas de selección genética y para la identificación de especies para evitar fraudes alimentarios.